(57) В настоящем изобретении предусмотрены, например, композиции и способы модулирования ответа хозяина на систему Gene Writer. В некоторых вариантах осуществления модуляция ответа хозяина приводит в результате к повышению уровня интеграции гетерологичной последовательности нуклеиновой кислоты, представляющей интерес, в геном-мишень. В некоторых вариантах осуществления модуляция ответа хозяина приводит в результате к повышению стабильности, например сохранению вставки или ее экспрессии. В некоторых вариантах осуществления модуляция ответа хозяина приводит в результате к снижению цитотоксичности.