Евразийский сервер публикаций

Евразийская заявка на изобретение № 202391791

   Библиографические данные

(11) Номер патентного документа

202391791

(21) Номер евразийской заявки

202391791

(22) Дата подачи евразийской заявки

2021.12.16

(51) Индексы Международной патентной классификации

C12Q 1/6881 (2018.01)
C12Q 1/6886 (2018.01)
G16B 30/00 (2019.01)

(43)(13) Дата публикации евразийской заявки, код вида документа

A1 2023.10.02 Бюллетень № 10  тит.лист, описание 

(31) Номер заявки, на основании которой испрашивается приоритет

20215730.1

(32) Дата подачи заявки, на основании которой испрашивается приоритет

2020.12.18

(33) Код страны, идентифицирующий ведомство или организацию, которая присвоила номер заявки, на основании которой испрашивается приоритет

EP

(86) Номер и дата подачи международной заявки

EP2021/086243

(87) Номер и дата публикации международной заявки

2022/129360 2022.06.23

(71) Сведения о заявителе(ях)

МЕДИКАВЕР БИОТЕК ЛТД (CY)

(72) Сведения об изобретателе(ях)

Коумбарис Джордж, Ахиллеос Ахиллеас, Элиадес Алексия, Лойзидес Хараламбос, Тсангарас Кириакос, Кипри Елена, Йоаннидес Мариос, Патсалис Филиппос (CY)

(74) Сведения о представителе(ях)
или патентном поверенном

Нилова М.И. (RU)

(54) Название изобретения

СПОСОБЫ КЛАССИФИКАЦИИ ОБРАЗЦА ПО КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫМ КАТЕГОРИЯМ

   Реферат  [ENG]
(57) В настоящем изобретении предложены способы и наборы для классификации биологических образцов по клинически значимым категориям. Способ включает этапы: (i) определения в образце, содержащем множество фрагментов внеклеточной ДНК (вкДНК), координат на последовательности для начала и/или конца по меньшей мере у 100000 фрагментов вкДНК путем выравнивания с референсной последовательностью; и (ii) определения в референсной последовательности всех мотивов нуклеиновой кислоты, состоящих из тринуклеотидов, тетрануклеотидов и пентануклеотидов. Указанные нуклеотиды: (a) находятся в диапазоне от 1 до 5 пар нуклеотидов по направлению внутрь, но рядом с координатой на последовательности для каждого начала и/или конца, определенной на этапе (i), и/или (b) находятся в диапазоне от 1 до 5 пар нуклеотидов по направлению наружу, но рядом с координатой на последовательности для каждого начала и/или конца, определенной на этапе (i). Затем на третьем этапе (iii) определяют частоту (a) каждой координаты на последовательности плюс и/или минус 1 пара нуклеотидов, определенной на этапе (i), во множестве фрагментов вкДНК, содержащихся в образце, и (b) каждого из мотивов нуклеиновой кислоты, определенных на этапе (ii) a) и b), во множестве фрагментов вкДНК, содержащихся в образце. Применяя эти частоты, вычисляют отношения каждой из частот, определенных на этапе (iii) a) и b), к соответствующей референсной частоте. Для каждого упомянутого выше отношения отдельно рассчитывают диагностическую оценку. На заключительном этапе вычисляют комбинированную диагностическую оценку по меньшей мере из двух или более определенных диагностических оценок. Диагностические оценки и комбинированные диагностические оценки позволяют классифицировать образец на клинически значимые категории, а комбинированная диагностическая оценка дополнительно позволяет классифицировать внеклеточную и/или циркулирующую опухолевую ДНК в образце как содержащуюся в низком, умеренном и высоком количестве.
Zoom in

 
Назад|  Новый поиск